O Programa de Mestrado em Ciências da Saúde da UESC promove a formação para o ensino superior de qualidade e o desenvolvimento da pesquisa, voltada para questões básicas e aplicadas em saúde e que contribuam para a inovação e o aperfeiçoamento acadêmico, científico e tecnológico no estado da Bahia. É parte integrante do Plano de Desenvolvimento Institucional (PDI) da UESC, no que diz respeito à consolidação e expansão de programas de pós-graduação stricto sensu, nas áreas de Ciências da Vida, Ciências Humanas e Ciências Sociais Aplicadas.

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​Esta proposta é um esforço conjunto de um Grupo de Trabalho, composto por docentes e pela direção do Departamento de Ciências da Saúde (DCS) e docentes dos departamentos de Ciências Biológicas (DCB) e Ciências Exatas e Tecnológicas (DCET). Reúne, portanto, um coletivo de perfil multidisciplinar com reconhecida atuação nas atividades de ensino e de pesquisa, e competências para acolher os futuros mestrandos do campo da saúde e de áreas afins. Um corpo docente que busca articular profissionais que atuam nas ciências básicas com aqueles da área profissional, e cumprir, mediante essa interação, a missão pedagógica e de produção e aplicação de conhecimentos para resolução de problemas relacionados ao processo de saúde e doença, à qualidade de vida e ao desenvolvimento econômico e social da região de influência da universidade, sem perder de vista sua atuação nacional e internacional.